تفاوت بین میکروسکوپ فلورسانس و میکروسکوپ معمولی
تفاوت بین میکروسکوپ نوری و میکروسکوپ الکترونی در این است که یک میکروسکوپ نوری فقط می تواند ساختارهای سلولی خاصی مانند دیواره های سلولی، کلروپلاست ها، کروموزوم های رنگ آمیزی شده، میتوکندری ها، هسته ها و غیره اندامک های کوچک را ببیند. به طور خلاصه، میکروسکوپ نوری می تواند ساختار میکروسکوپی سلول ها را ببیند و میکروسکوپ الکترونی می تواند ساختار زیر میکروسکوپی را ببیند.
تفاوت اصلی در بزرگنمایی است. میکروسکوپ های نوری دارای محدودیت بزرگنمایی هستند و هر چقدر هم که زوم بزرگ باشد، چشم انسان نمی تواند آن را تشخیص دهد. y(min)=0.61*طول موج)/(n*sinu) —— حتی اگر n*sinu در روغن غوطه ور شود، حداکثر حدود 1.5 است و بقیه به اندازه طول موج بستگی دارد. بنابراین، حداکثر میکروسکوپ نوری حدود 1000 برابر است و بزرگنمایی بی فایده است. میکروسکوپ های الکترونی از پرتوهای الکترونی برای تصویربرداری استفاده می کنند و طول موج آن بسیار کوچکتر از نور مرئی است، بنابراین حداقل فاصله تفکیک پذیری y(min) بسیار است. جزئیات کوچکتر و کوچکتر را می توان حل کرد و بزرگنمایی می تواند به چندین میلیون برسد
